補充孕激素治療主要見于兩個方面，一個方面是非孕期黃體功能不健，一般表現為月經周期縮短，檢查孕酮較低，診斷黃體功能不健，建議在月經周期后半期，黃體期補充孕激素治療，當然在這個階段，也可以多吃一些豆制品，也有一定的幫助。
孕期一般也要檢查孕酮，如果孕酮水平低于20ng/ml，一般考慮孕酮較低，這時多診斷先兆流產，也要給與補充孕激素治療，但是在補充孕激素治療之前，一般要除外宮外孕、胚胎停育等特殊情況，這些特殊情況常常也表現為孕酮較低，要做B超檢查，如果B超檢查未見宮內孕囊，要進一步檢查血HCG，如果血HCG，超過2500~3000IU/L，B超未見宮內孕囊，這時診斷宮外孕，就不需要補充孕酮了，也不宜多吃各種豆制品，要給與宮外孕的特異治療。
如果B超提示宮內孕囊孕酮較低，一般考慮先兆流產，要給與補充孕激素治療，也可以多吃一些豆制品，有一定幫助，但如果孕囊持續兩周以上未見胎心或者孕囊平均直徑，二點五到三公分以上未見胎心，這時考慮胚胎停育，要清宮終止妊娠。