每日晨起，使用糠酸莫米松鼻噴霧劑前最好先使用鼻腔沖洗器清理鼻腔，擤干凈鼻子后，每個鼻孔各噴1~2下。
在每次用藥前充分振搖容器，通常先手撳噴霧器6~7次作為啟動，直至看到均勻的噴霧，然后鼻腔給藥，如果噴霧器停用14日或14日以上，則在下一次應用時應重新啟動。
噴鼻子時，含首低頭位，左手噴右鼻孔，右手噴左鼻孔，交叉噴鼻子。如果癥狀未被有效控制，可增加劑量至每側鼻孔4撳的最大每日劑量，一日1次，在癥狀控制后減小劑量。
糠酸莫米松鼻噴霧劑屬于鼻用糖皮質激素，而鼻用糖皮質激素屬于治療過敏性鼻炎和鼻竇炎的一線藥物，但往往需要跟其他藥物聯合使用，用于治療過敏性鼻炎或鼻竇炎時，鼻內糖皮質激素具有抗炎抗水腫的作用，療程不少于12周。