兩個月寶寶用藥的注意事項和禁忌較多，如果發燒的情況不是很嚴重，可以通過適當減少衣物、多喝溫水、溫水浴等方式改善，如果發燒嚴重，建議立即就診。
退熱藥物需通過肝臟轉化代謝為有生理活性的成分，從而發揮調控體溫調節中樞調節體溫的作用。兩個月寶寶的肝腎功能發育不健全且不成熟，藥物蓄積易致肝腎損傷，甚至不可逆的組織結構變性壞死。所以原則上不建議２月齡以內嬰兒使用退熱藥物。
當兩個月寶寶發燒時可使用熱毛巾外敷兒童額頭、溫水浴、減少穿著的衣物、退熱貼、退熱毯、風扇和降低室內溫度等方法，通過傳導、對流及蒸發作用帶走身體的熱量，使發熱寶寶感到舒適。同時需給寶寶補充適量的水分，以免引起寶寶脫水。
但當寶寶因發熱導致不舒適和情緒低落明顯不適時，可在醫生指導下給予退熱藥物如布洛芬，兩次用藥至少間隔6小時。
針對引起發熱的原因進行治療對于體溫恢復也很重要。如為細菌感染引起，需使用頭孢克肟、頭孢曲松等藥物抗感染治療；如為川崎病等免疫性疾病，需使用注射用免疫球蛋白、阿司匹林等藥物進行治療。
引起寶寶發熱的原因還有很多，建議及時就診，由專科醫生評估處理。上述藥物均需在醫生指導下使用，避免自行用藥。
兩個月寶寶發燒可能是急性上呼吸道感染、肺炎、幼兒急疹等引起的，需要針對性采取一般治療、藥物治療。
在寶寶發燒時首先對癥處理，若體溫沒有超過38.5度，可采取物理降溫，例如溫水浴、貼退熱貼，若體溫超過38.5度，及時使用退燒藥，例如對乙酰氨基酚等，然后進行對因治療。
1.上呼吸道感染：多見于病毒感染，目前尚無特效的抗病毒藥物，主要是多讓寶寶喝水，多休息；若繼發細菌感染，需給寶寶口服抗生素藥物，例如阿莫西林、頭孢拉定等。
2.肺炎：若是細菌性肺炎病情輕微時，可給寶寶口服阿莫西林克拉維酸鉀、阿莫西林等，若病情嚴重時須靜脈輸液治療。對于支原體肺炎，需要口服大環內酯類抗生素藥物，例如紅霉素、阿奇霉素等。
3.幼兒急疹：大多數幼兒急疹會自行恢復，不需要特殊治療，主要是對癥降溫，并多讓寶寶喝水，注意監測體溫。
兩個月寶寶發燒還有可能是因為其他原因引起的，例如腦膜炎、腦炎、急性腸炎等，為避免耽誤治療，應及時就診，查明原因后配合醫生治療，不可自行隨意給寶寶用藥。以上用藥均需在醫生指導下使用，避免自行用藥。