漢坦病毒主要引起腎綜合征出血熱，本病治療以綜合療法為主，早期應用抗病毒治療，中晚期則針對病理生理進行對癥治療。
總的來說，漢坦病毒引起的腎病綜合征出血熱的治療，“三早一就”仍然是本病的原則，即早發現、早期休息、早期治療和就近治療。治療中要注意防治休克、腎功能衰竭和出血。在本病的發熱期治療以抗病毒、減少外滲、改善中毒癥狀和預防DIC為主。抗病毒可用利巴韋林靜脈滴注，可給予路丁、維生素C等以降低血管通透性減少外滲并每天輸平衡鹽溶液或葡萄糖鹽水1000ml左右，高熱以物理降溫為主忌用發汗退燒藥，中毒癥狀重者可給予地塞米松5~10mg靜滴，適當給予低分子右旋糖酐或丹參注射液靜滴以預防DIC；在本病的低血壓休克期要積極補充血容量、主要糾正酸中毒和改善微循環；在本病的少尿期以“穩、促、導、透”為治療原則，即穩定機體內環境、促進利尿、導瀉和透析治療；在本病多尿期早期和多尿移行期治療同少尿期，多尿后期主要是維持水、電解質平衡，防治繼發感染；在本病恢復期注意補充營養，定期復查腎功能。