幽門螺桿菌最佳根除法一般是四聯療法，另外還要注意飲食衛生。
四聯療法是目前根治幽門螺桿菌最常用的治療方法，根治率能達到90%以上，主要是使用兩種抗生素，一種鉍劑和一種質子泵抑制劑進行治療，如奧美拉唑、阿莫西林、克拉霉素、果膠鉍，一般治療14天可以根除。對于少數不能根除的，也可以通過補救治療的方法繼續治療，主要是選擇敏感性的抗生素進行個體化治療。
四聯療法的根治率雖然很高，但是幽門螺桿菌會通過人與人之間傳染，根除后可能會再次傳染，所以平時應該要注意個人衛生，勤洗手，養成良好的飲食習慣，建議進行分餐制，認真清洗碗筷，盡量減少在公共場合就餐。
幽門螺桿菌四聯療法應該嚴格遵醫囑用藥，不要隨便用藥，避免產生不良反應。
幽門螺桿菌的四聯療法是一種質子泵抑制劑，再加上一種鉍劑，再加上兩種抗生素。這一種質子泵抑制劑最常用的可能就是從80年代使用的奧美拉唑，到后來的雷貝拉唑、埃索美拉唑等等，目前市面上大概有七八種藥物。鉍劑是抑制幽門螺桿菌生長的藥物，市面上常用的包括得必泰或者是麗珠得樂等等。抗生素在中國用的比較多的就是阿莫西林，再加上克拉霉素也就是紅霉素這樣的藥物。當然有的患者可能會出現阿莫西林過敏的情況，這個時候可以把它換一換，換成其它的抗生素，比如換成紅霉素、換成了四環素，再或者是換成甲硝唑、替硝銼等這些藥物?？死顾赜械幕颊邥霈F腹痛、腹瀉的癥狀，這個時候也可以把它換成其它的抗生素，比如利復星等。
當然，目前隨著整體醫療水平的提高，可以在胃鏡下取一塊小肉肉過來，做一個整體的幽門螺桿菌的藥物敏感試驗，這樣根據藥藥敏實驗來進一步指導我們的根除療法，這樣針對性更強、效果更好。
殺幽門螺桿菌的最好最有效的方法是采用四聯療法。
目前推薦鉍劑四聯作為主要的經驗性根除幽門螺桿菌的方案。包括鉍劑、質子泵抑制劑、兩種抗生素，經典鉍劑四聯方案如：由質子泵抑制劑、鉍劑、阿莫西林以及克拉霉素組成。
對于第一次根除治療失敗的患者，醫生可在半年后在剩余的治療方案中選擇另一種進行補救治療，對多種抗生素耐藥者治療前可以做藥敏試驗來選擇敏感的抗生素，對于反復治療失敗的患者需要繼續治療時，醫生會對患者進行個體化整體評估。
一般通過醫生指導下規范的根除幽門螺旋桿菌的藥物治療，幽門螺桿菌感染可以治愈，但如果不注意飲食衛生和生活習慣，仍可以再次感染。