泮托好些。
泮托拉唑和奧美拉唑都是中和胃酸的藥物，緩解胃酸分泌過多造成的胃腸道疾病。兩種藥物都屬于質子泵抑制劑，泮托拉唑研制時間比奧美拉唑得研制時間長，出廠晚，泮托拉唑在弱酸環境中停留時間長，藥性更穩定，作用抑制胃酸的時間長，而且口服的作用更強，更容易吸收。在抑制胃酸分泌的同時也能減少胃液分泌，胃液分泌最主要成分包括水、有機物和無機鹽。抑制胃蛋白酶分泌同時抑制幽門螺桿菌感染。幽門螺桿菌感染可以促進胃分泌更多胃酸，是機體處于一個高酸環境，對人體有極大的損傷。
奧美拉唑是最早應用于治療消化系統疾病的抑制劑，第一代藥物發現早，臨床實踐可能缺乏，所以一般副作用比較大，利用率也比較小。由于生物技術發展較快，泮托拉唑在奧美拉唑的基礎上對母體結構進行改造而成，屬于第三代質子泵抑制劑，其安全性、有效性及生物利用率較奧美拉唑更高，更加適合人體需要。
一般來說泮托拉唑相對較好些。奧美拉唑和泮托拉唑都是質子泵抑制劑，對抑制胃酸均有較好的效果，主要從生物利用度和用藥安全性兩方面對比。
1.泮托拉唑是質子泵抑制劑第三代，奧美拉唑是第一代。泮托拉唑生物利用度主要指被吸收進入人體循環的速度與程度比奧美拉唑要好，能夠更好的抑制胃酸。
2.安全性主要指泮托拉唑的副作用相對較小，不易發生藥物不良反應，如惡心、嘔吐、腹瀉等，與其他藥物配伍時安全性相對較好。
建議在專業醫生指導下，根據疾病不同情況，選擇不同類型的藥物治療，切不可盲目用藥。