一般來說，在新三板的企業被稱之為掛牌，而在主板交易的股票才叫做上市。
掛牌和上市主要有以下幾點的區別：
1、交易場所不同：上市的場所是在深圳證券交易所、上海證券交易所和北京證券交易所三個國家級證券交易中心。新三板又叫做股轉代辦系統，掛牌是證券公司為非上市公司提供股份轉讓服務業務，公司股份并沒有在證券交易所掛牌，而是通過證券公司進行交易。
2、公司發展階段不同：上市公司一般都處于相對成熟的階段，規模較大。而掛牌主要是為創新型、創業型、成長型中小微企業發展服務，公司規模都比較小。
3、交易門檻不同：掛牌的門檻相對較低，對公司財務門檻沒有限制，申請掛牌的公司可以尚未盈利。只要股權結構清晰、經營合法規范、公司治理健全、業務明確并履行信息披露義務的股份公司均可以經主辦券商介紹申請在全國股份轉讓系統掛牌。而上市卻對公司經營狀況、公司規模、企業利潤、行業、發展前景都有明確的規定，要求嚴格。
4、投資群體不同：我國交易所市場的投資者結構以中小投資者為主，在A股市場上，機構、游資、散戶、外資都能交易。而全國股份轉讓系統實行了較為嚴格的投資者適當性制度，未來的發展方向將是一個以機構投資者為主的市場。
5、風險程度不同：掛牌的要求相對于上市來講要低很多，加上掛牌公司大多屬于成長型企業，不夠成熟，一般來講掛牌公司的風險程度要高于上市公司。
6、交易的流動性不同：掛牌股權交易流動性較差，而上市公司股票交易的流動性較強。