子宮內膜異位癥要做婦科檢查：雙合診、三合診，或者影像學檢查和腹腔鏡檢查，也可以進行血清ca125測定。
1.婦科檢查：宮骶韌帶和后穹窿有觸痛性結節為特征性的體征。
2.影像學檢查：確定卵巢子宮內膜異位囊腫的形狀、位置、大小和囊內容物，與周圍臟器，特別是與子宮的關系等需要進行陰道和腹部超聲檢查。盆腔CT及MRI對盆腔內異癥雖然有診斷價值，但費用較昂貴，收入一般的家庭，不建議使用。
3.腹腔鏡檢查：目前診斷內異癥的最佳方法就是腹腔鏡檢查。在腹腔鏡下見到大體病理所述典型病灶或對可疑病變進行活組織檢查即可確診，術中所見亦是臨床分期的重要依據。
4.其他輔助檢查：血清CA125測定：血清CA125水平有增高的可能性，重度患者增高的比較明顯，但是變化范圍比較大。臨床上多用血清CA125治療重度內異癥和疑有深部異位病灶者。CA125診斷內異癥的敏感性和特異性均較低，但血清CA125水平用于檢測異位內膜病變活動更有臨床價值，有助于評估療效和預測復發。