兒童腺樣體遵醫囑手術能避免孩子發育不良，對孩子日后的身體健康基本上是沒有不良影響，不會留下后遺癥。
腺樣體對于兒童身體的危害取決于其腫大的程度。如果是輕度腫大，一般不建議切除；如果腫大的程度影響到了兒童的睡眠或者呼吸情況，建議需要切除。
腺樣體屬于免疫組織，切除后會降低兒童的免疫功能。但是若其腫大的程度使兒童反復出現炎癥，同時影響呼吸、睡眠等情況，長時間下去容易導致兒童腦部發育的供氧不足，也會造成生長發育不良，使兒童的抵抗力下降，容易生病。
當前采取的是微創手術，對患兒影響非常小，隨著科技進步，從傳統腺樣體刮除術到腺樣體吸切術，現在到腺樣體等離子射頻消融術，手術技術提高，設備越來越完善，在手術過程中患兒出血非常少，幾乎不出血，所以沒有什么危害，術后疼痛明顯減輕，術后患兒基本在1天之內就可以出院。