膽固醇低可見于甲狀腺功能亢進癥；嚴重的肝臟疾病，如肝硬化和急性重型肝炎；貧血、營養不良和惡性腫瘤等；應用某些藥物，如降脂藥物、雌激素、甲狀腺激素、鈣拮抗劑等。膽固醇太低會影響細胞膜、性激素、皮質醇激素和膽汁酸的生理作用。
有些疾病建議降低膽固醇，并維持在較低水平，如冠心病、糖尿病等高危疾病患者，總膽固醇小于4mmol/l，低密度脂蛋白小于1.8mmol/l。
膽固醇是人體不可缺少的營養物質,是細胞膜、性激素、皮質醇激素和膽汁酸的重要成分，對維持免疫細胞的穩定性有著重要的生理作用。
若血內膽固醇水平病理性極低，會使細胞膜的穩定性減弱，導致細胞膜彈性降低，脆性增加，腦內小血管缺乏外周組織支撐，抵抗血壓變化能力較低，當血壓升高時血管容易破裂出血，造成心腦血管疾病的發生，如腦出血。
膽固醇是人體必不可少的重要物質，是血液中各種脂蛋白所含的膽固醇的總和。影響膽固醇的因素主要有：第一、年齡和性別。膽固醇隨著年齡的增長而增加，但是七十歲以后不增反降。女性膽固醇低于男性，絕經后的女性膽固醇高于同齡的男性。第二個是飲食習慣。長期高膽固醇、高飽和脂肪酸的飲食，會增加膽固醇。第三是遺傳因素。與脂蛋白代謝相關的酶，或者是受體基因發生突變的時候，會引起膽固醇的顯著增加。
造成膽固醇偏低的原因有很多，比如說一味的長期的素食、偏食會使膽固醇、脂肪、蛋白質攝入不足，會導致低膽固醇血癥。某些疾病如惡性腫瘤等等，也會導致膽固醇偏低。
膽固醇偏低對人體有哪些傷害：第一個就是它會使人體免疫力下降。因為它會影響皮質激素的形成，導致合成減少，使人的免疫力低下。第二個，血管容易破裂、出血。如果膽固醇水平偏低，會使細胞膜的穩定性減弱，導致細胞膜彈性下降，血管容易破裂、出血。第三個，容易患腫瘤。有些膽固醇偏低，是由于營養不良而引起的，會導致患者身體更虛弱，抗病能力下降，導致各種疾病的發生。當然也包括惡性腫瘤，特別是消化道腫瘤。第四個，是膽固醇偏低，還會降低性激素的合成，從而影響病人的性功能。因此建議對于那些膽固醇偏低的患者，可以通過食補的方法，提高膽固醇的含量，增加飽和脂肪和高膽固醇食物的攝入，比如說魚類、蛋類、大豆卵磷脂、動物內臟等等，但是最好日攝入量應該控制在300mg以下。