梔子本身是祛病的藥不是養生的藥，有病時吃。熱擾胸膈時用三焦梔子豉湯來治療，還可以治療三焦都熱的出現。患者高熱、煩躁、神志昏迷時用黃連解毒湯。梔子還會退黃。患者周身出現黃疸，配合茵陳、大黃，叫茵陳蒿湯，是《傷寒論》的方子。用梔子柏皮湯是《金匱要略》的方子來退黃。
血淋是尿血，小便紅一查都是紅細胞，用梔子配上木通、車錢、滑石，像八正散，治療小便血尿。當熱象很重，吐血或鼻出血時，用梔子配上白茅根、側柏葉，像石灰散，治療胃腸道、上呼吸道出血。配合黃芩、黃連、黃柏，治療三焦火盛導致的吐血。黃連解毒湯可以瀉三焦經的火。肝膽火熱上攻時眼睛紅腫脹痛，用梔子湯生機矚目的方子，配上大黃。治火毒瘡瘍、紅腫熱痛，配上銀花、連翹、蒲公英可以消腫。
梔子是清熱瀉火，清熱利濕，清熱涼血，清熱解毒，清瀉肝膽、三焦、心的內熱，是瀉火涼血止血的藥。梔子可以治療濕熱型的黃疸，比如急性傳染性肝炎、血清性肝炎等。
梔子這個藥苦寒，可以入心經、肝經、肺經、胃經和三焦經。臨床上常用于以下幾方面：
一、用于治療燒傷的感染，有發熱、煩熱、煩渴、煩躁這些熱性的癥狀，可以用梔子來清熱解毒。
二、治療咳血、鼻血這些濕熱的癥候，如果梔子用梔子炭的話，它還可以涼血、止血。
四、治療多種炎性的疾病發炎，比如有肝熱的癥候，主要表現有目赤腫痛、流淚多、口苦、口干、心中煩熱、睡眠不安。
五、在眼科可以用于治療流行性的結膜炎，也就是紅眼病。
六、在腎病科可以用于治療腎盂腎炎、尿道炎、小便不利。
七、在外科的應用上可以治療跌打損傷、挫傷。這樣可以把梔子研成末，用面粉、雞蛋調勻，外敷在患處，可以清熱止痛。