治療慢性咽喉炎的藥物包括復方硼砂溶液、呋喃西林液含漱，含服薄荷喉片等，以及六神丸和清音丸等中成藥制劑。
慢性咽喉炎的治療包括：
1．去除病因：戒除煙酒、改善工作和生活環境（避免粉塵及有害氣體）、積極治療鼻和鼻咽部慢性炎癥、有胃食管反流者服用抑酸制劑、糾正便秘和消化不良、治療全身性疾病以增強抵抗力，對本病的防治甚為重要。
2．中醫中藥：中醫認為慢性咽炎系陽虛火旺，虛火上擾，以致咽喉失養。治療宜滋陰降火，用增液湯加減。亦可用雙花，麥冬適量，加胖大海二枚，用開水泡代茶飲之。
3．局部療法：慢性單純性咽炎，常用復方硼砂溶液、呋喃西林液、2％硼酸液含漱，含服喉片，如碘喉片、薄荷喉片、銀黃喉片及服用六神丸和清音丸等；慢性肥厚性咽炎，除了用上述方法處理外，還需對咽后壁淋巴濾泡進行處理，可用化學藥物，如10％硝酸銀溶液燒灼肥大的淋巴濾泡，也可用冷凍或激光治療。但處理范圍不宜過大過深，以防日后咽部干燥，咽黏膜萎縮。
藥物治療應在醫生指導下進行。