功能性消化不良的患者，可以遵醫(yī)囑服用促胃腸動(dòng)力藥物如多潘立酮、抑酸護(hù)胃類藥物如奧美拉唑，及促消化的中成藥如保和丸等進(jìn)行治療，由幽門螺桿菌感染引起者，需進(jìn)行質(zhì)子泵抑制劑+鉍劑+2種抗生素的四聯(lián)治療。
首先，功能性消化不良多是由于胃腸動(dòng)力較差所引起，此時(shí)患者可服用促胃動(dòng)力藥物進(jìn)行治療，臨床上常見的藥物有多潘立酮片、枸櫞酸莫沙必利分散片、鹽酸依托必利分散片等。
其次，功能性消化不良的患者出現(xiàn)胃酸、燒心、胃脘不適的癥狀時(shí)，可以服用抑酸護(hù)胃類藥物進(jìn)行治療，常見的有奧美拉唑腸溶膠囊、泮托拉唑腸溶片、雷貝拉唑腸溶片等。
另外，功能性消化不良的患者出現(xiàn)食欲不振、腹脹等癥狀時(shí)，可以辨明證型后服用保和丸、健胃消食片、山楂丸等中成藥進(jìn)行治療。
若是患者感染幽門螺桿菌后出現(xiàn)了消化不良的癥狀時(shí)，可以質(zhì)子泵抑制劑如蘭索拉唑腸溶片+鉍劑如膠體果膠鉍膠囊+2種抗生素如阿莫西林膠囊、克拉霉素緩釋片等藥物進(jìn)行殺菌治療，青霉素過敏者，可將阿莫西林膠囊改為四環(huán)素片。
出現(xiàn)功能性消化不良的癥狀時(shí)，需要及時(shí)前往專業(yè)的消化內(nèi)科門診進(jìn)行治療，在專業(yè)消化內(nèi)科醫(yī)師的指導(dǎo)下正確用藥治療。