腸胃炎一般服用抗生素、胃黏膜保護劑、補液鹽、止吐藥、解痙藥、止瀉藥等。
臨床一般分為急性腸胃炎、慢性腸胃炎，感染性腸胃炎和非感染性腸胃炎，根據病情和病因選擇用藥，但藥物應在醫生指導下應用。
1.抗生素：感染性腸胃炎一般用諾氟沙星(18歲以下禁用)、左氧氟沙星（18歲以下禁用）、頭孢類藥物。
2.胃黏膜保護劑：常用果膠鉍、硫糖鋁、鋁碳酸鎂等。
3.補液鹽：主要是按比例補充5%碳酸氫鈉、生理鹽水和葡萄糖及電解質。主要是補液，預防水電解質紊亂。
4.止吐藥：患者若存在嘔吐，可使用甲氧氯普胺、溴米那普魯卡因注射液等藥物。
5.解痙鎮痛藥：腹痛明顯的患者可用顛茄片、阿托品、山莨菪堿片等藥物緩解。
6.止瀉藥：腹瀉時可用洛哌丁胺、蒙脫石散治療。
胃腸炎建議醫院消化內科就診，根據具體病情和病因遵醫囑選擇用藥，規范治療，不可自行用藥，以免耽誤病情。
治腸胃炎的藥有抗炎的藥物、調整腸胃功能紊亂的藥物、保護腸胃黏膜的藥物以及抑制胃酸分泌的藥物。藥物必須在醫生指導下使用，切勿自行使用。
（1）抗炎的藥物：常用的有喹諾酮類藥物和蒙脫石散，喹諾酮類藥物有諾氟沙星膠囊、氟哌酸膠囊、環丙沙星片等。當患者因胃腸道感染時服用此類藥物，可以控制胃腸道受到的感染。
（2）調整腸胃功能紊亂的藥物：如乳酸菌素片。如果是因腸胃功能紊亂、消化不良所引起的腸胃炎，可以服用此類藥物。
（3）保護腸胃黏膜的藥：如硫糖鋁、思密達、腸炎寧、胃炎顆粒。
（4）抑制胃酸分泌的藥物：如奧美拉唑、蘭索拉唑、西沙比利。由于胃酸分泌過多容易刺激胃黏膜，所以常將抑制胃酸的藥物與保護胃黏膜的藥聯用，臨床上對保護胃黏膜有很好的療效。