病毒感染引起的性傳播疾病常見有尖銳濕疣、生殖器皰疹以及艾滋病、乙型病毒性肝炎、丙型病毒性肝炎等。
尖銳濕疣是由人乳頭瘤病毒（HPV）感染所致的以肛門生殖器部位增生性損害為主要表現的性傳播疾病。大多發生于中青年人群，大約經過平均為3個月的潛伏期后發病，主要通過性接觸傳播。生殖器皰疹是由單純皰疹病毒（HSV）引起的性傳播疾病，主要是HSV-2型，少數為HSV-1型，生殖器皰疹可反復發作，還可通過胎盤及產道感染新生兒，導致新生兒先天性感染。
艾滋病毒可經性途徑傳播引起獲得性免疫缺陷綜合征，特別是青中年的人群中男男同性戀成為性傳播途徑的主要群體，急性期癥狀有發熱、肌肉關節酸痛、咽痛等非特異癥狀，持續時間短，不易發現。艾滋病毒感染后數周才能檢測到用于診斷的艾滋病抗體，但此期的患者血清可檢測出艾滋病病毒RNA，具有傳染性，因此，發生高危性行為后應有主動就診意識，在專業醫生的指導下進行感染的阻斷。
乙肝病毒、丙肝病毒通過除可以經血液、體液傳播外，也可經性接觸途徑傳播，引起乙型肝炎、丙型肝炎，急性期主要癥狀有惡心、食欲減退、乏力等，可轉為慢性感染，少數病例可發展為肝硬化或肝細胞癌。無論慢性乙肝或慢性丙肝患者，只要符合抗病毒指征，應積極服用抗病毒藥物，目的是抑制病毒復制，降低傳染性，減輕肝臟損傷，減少或避免肝硬化甚至肝癌的發生，改善長期預后。
生殖系統感染是細菌、真菌等病原微生物侵入生殖系統而引起的疾病。生殖系統感染好發部位主要是女性的宮頸口、陰道、外陰口及尿道口；男性則是陰莖和尿道口。
女性常見的生殖系統感染有外陰炎、宮頸炎、陰道炎、滴蟲性陰道炎和念珠菌性陰道炎，臨床表現為白帶異常、外陰瘙癢等，宮頸炎還會伴有腰酸、小腹墜脹等。
男性常見的生殖系統感染有細菌性前列腺炎、急性附睪炎，細菌性前列腺炎，炎癥急性發作的臨床表現為尿頻、尿痛、會陰肛門灼熱感、寒戰、發熱等，慢性炎癥表現為尿頻、排尿不適、腰骶會陰部酸痛、尿道口滴白。
生殖系統感染患者需要到醫院就診，遵醫囑完善相關檢查并進行治療。