嬰兒便秘的治療方法包括養成排便習慣、改善飲食結構、益生菌或者開塞露輔助排便、手術治療等，具體治療方案應該根據病因及個人情況選擇，沒有所謂的“最快”的方法，請遵醫囑治療。
1.嬰兒便秘大多數是功能性的或者與飲食有關，嬰兒由于肌肉、神經等還處于發育階段，排便反射較弱，需要給嬰兒養成定時定期排便的好習慣。
2.長期食用高蛋白質而少糖的食物容易造成大便干結而使嬰兒便秘，這種情況下只需要調整飲食結構即可。
3.若是奶量或者輔食進食少，也會導致大便形成速度慢，造成便秘的假象，而且長期進食不足，會影響身體的正常發育進而影響排便功能。像這些情況，通常只需要適當服用腸道益生菌復制消化或者直接應用開塞露緩解癥狀，這個改善的過程相對來說都需要較長的時間。
4.嬰兒便秘若是先天性巨結腸、先天性甲狀腺功能低下等病理因素造成的，那么可能需要根據患兒病情嚴重程度、年齡、全身狀況等多種因素選擇相對應的藥物或者手術治療。
嬰兒便秘的治療不可求快，一定要對因對癥治療，切勿自行用藥延誤病情造成嚴重后果。