菜花狀的疙瘩應根據所在部位結合病情及相關檢查綜合考慮。
若發生在生殖器部位，可考慮是尖銳濕疣，患者可帶有明顯的疼痛和瘙癢等癥狀。尖銳濕疣是一種人類乳頭瘤病毒（HPV）感染性疾病，主要通過性接觸傳播，常發于生殖器和肛周溫暖潮濕的部位。尖銳濕疣的形態是多種多樣的，根據其形態的不同，可分成雞冠型、丘疹型、菜花型、蕈樣型、乳頭型。另外，因為疣體的表面粗糙不平，所以常常因為摩擦或浸漬而出現破潰、出血，易發生感染。尖銳濕疣從形態學上有其特征性的表現，即生殖器部位的疣狀增生性組織外觀類似于菜花狀，但是不能絕對的就說菜花狀的疙瘩就是尖銳濕疣。有的疙瘩發生在皮膚的其他部位，比如手臂或者腳上的菜花狀的疙瘩可能是尋常疣。雖然也是HPV感染的一種病毒疣，但是和尖銳濕疣還是有一定差別。