奧美拉唑，對于十二指腸潰瘍和卓～艾綜合征的治療有較好作用，同時也適用于胃潰瘍和反流性食管炎的治療。靜脈注射的辦法可用于治療消化性潰瘍急性出血。奧美拉唑與甲硝唑及克拉霉素同時用，或奧美拉唑與阿莫西林及克林霉素同時用，用這樣的方法來達到清除幽門螺桿菌的目的。
奧美拉唑的作用機理是抑制胃酸分泌，屬于質子泵抑制劑類藥物。所謂質子泵，就是當胃壁細胞分泌氫離子以后，需要經過H～K～ATP酶的作用，才能從細胞中出去，從而進到胃中。而H～K～ATP酶就相當于一個泵，它可以不斷地將細胞內的氫離子泵到細胞外，進而人到胃里面，氫離子的積聚造成胃酸增加。奧美拉唑這類藥對這個泵起特異性作用，抑制或者阻斷泵的功能，直到細胞生產出新的泵為止。在臨床上，因為胃酸分泌過多而導致的疾病或者癥狀，可以通過保護胃黏膜這種途徑來進行治療。另外，如果將奧美拉唑與阿莫西林、克林霉素，或與甲硝唑、克拉霉素同時用，可以達到殺滅幽門螺桿菌的作用。在短期內服用奧美拉唑耐受性比較好。主要有惡心、腹脹等胃腸道癥狀的不良反應，也會導致頭暈、頭痛等神經癥狀，長久服用還可能造成骨折、感染等等之類的后果。