胡黃連性味苦、寒，入肝、胃、大腸經，具有清虛熱、除濕止瀉、抗菌抑菌等多種功效與作用。
1、清虛熱
胡黃連性味苦、寒，具有清熱解毒的作用，其中以清虛熱為主，臨床上可用于治療陰虛引起的骨蒸潮熱、盜汗、心煩氣躁、五心煩熱等，常與銀柴胡、地骨皮等配伍應用。
2、除濕止瀉
胡黃連性味苦，可入大腸經，與黃連有些類似，可祛除胃腸濕熱、下焦濕熱蘊結，是治療濕熱痢疾、痔瘡腫痛的一味良藥，常與黨參、白術等中藥配伍應用。
3、抗菌抑菌
胡黃連對于金黃色葡萄球菌、霍亂弧菌以及乙型鏈球菌等作用較強，可以起到抗菌消炎之功效。可是，對于大腸桿菌、傷寒桿菌等作用較弱。