對于皰疹的治療，主要以藥物治療為主，可以配合物理治療促進恢復。
皰疹一般由是病毒感染引起，可以服用抗病毒藥物治療，例如阿昔洛韋、更昔洛韋、泛昔洛韋等。還可以服用免疫調節劑治療，例如轉移因子口服液、胸腺素片等。還可以局部外用阿昔洛韋軟膏、噴昔洛韋軟膏。如果患者伴有明顯神經痛，可以服用營養神經及止痛的藥物，例如甲鈷胺片、加巴噴丁膠囊等。如果想要促進恢復，局部可用紅藍光照射治療。
建議患者去醫院皮膚科就診，在醫生的指導下用藥，不可以自行用藥。
皰疹包括單純皰疹和帶狀皰疹。這里的皰疹主要是指單純皰疹，尤其是生殖器皰疹。
生殖器皰疹是由于感染了單純皰疹二型病毒所引起來的表現在生殖器部位水皰發作的疾病，按照目前治療方法和人類的免疫力，一旦感染單純皰疹病毒之后，人的免疫力是不能完全把這個病毒從身體清除掉的。因此目前的治療都不能使皰疹病毒去根的。
皰疹病毒會潛藏在人的相應神經分布節段的神經節內。當人的免疫力降低，病毒會被激活、復制，表現在皮膚粘膜上反復出現的水皰。
皰疹雖然不能除根，但并不意味著皰疹會持續的沒完沒了的發作。只要保持好的生活習慣，配合適度的營養、適度的體育鍛煉，我們是可以降低或者使皰疹病毒不再復發都是有可能的。
必要的時候，可以配合一些提高免疫力的藥物，發病期間可以配合口服一些抗病毒的藥物，都是降低皰疹病毒的復發率的有效方法。