水果酵素一般是由一種或幾種水果發酵而成。水果酵素含有人體需要的酵素及豐富的營養物質，能夠提高人體機能，提高免疫力。水果酵素還能促進身體的代謝，加強體內脂肪快速燃燒，達到減肥的效果。
水果酵素是一種保健品，雖有文章稱水果酵素具有抗氧化、調節機體免疫能力等作用和功效，但尚未有權威資料證實。
水果酵素是指以水果、蔬菜等為原料，經微生物發酵制得的含有特定生物活性成分的產品。水果酵素并非純粹的酶，而是富含多種維生素、酶、氨基酸、有機酸、多糖、多酚、黃酮、礦物質、有益微生物及其活性代謝物等的混合物。
水果酵素中的活性功能成分，可直接參與人體新陳代謝，提高機體的抗氧化能力，并具有一定的免疫調節作用和功效。
需要注意的是，保健品不能代替藥物治療疾病，若患有疾病，需及時到醫院檢查治療。食用酵素產品種類繁多但質量參差不齊，生產工藝及菌種差異明顯、缺乏統一規范，相關標準和法律法規未及時出臺因而難以進行有效的市場監管等。因此，選擇食用酵素進行保健作用要謹慎。