1、花費時間更多
雖然做超短交易的持有時間很短，但是其交易比較頻繁，所以就相當于不停地在選擇新的股票投資，還有看盤。超短交易就需要花費大量的時間和精力去挑選股票，并且市場是時刻變動的，價格也是。
再一個看盤時間過長的話，容易早場身體疲憊，過度緊張，交易日每天交易好幾個小時，期間超短的投資者都一直是精神高度緊繃狀態，盤口的變化也會影響投資者的判斷和心情。所以大部分投資者覺得做超短交易比較考驗投資者的身體素質，很難接受。
2、沖動交易
因為超短交易的變化較快，包括技術面，消息面的不斷變化會影響投資者的判斷，有些投資者就容易被帶偏，沖動交易。
3、交易手續費高
超短的交易特別頻繁，雖然每次的費用并沒有多少，但是常年累計的話也是一筆較大的費用，主要是包括印花稅和各種交易費用。
4、全面注冊制的實行使得超短比以前更難操縱，具體體現在下面這些方面：
（1）漲跌幅限制
注冊制實行后漲停打板不能讓高于漲幅2%的掛單，否則被認為掛的單為廢單，這樣就會直接導致超短線交易接力空間急劇減少。
（2）個股波動增大
注冊制之后，滬市主板、科創板還有創業板個股在上市后前五個交易日是沒有漲跌幅限制的，所以會導致其波動性增大、不確定性加大，增加了其風險性。一旦散戶判斷錯誤，將會導致損失慘重。
（3）個股上市門檻降低
實行注冊制后，規定企業的上市門檻降低，也就是說上市公司的質量相比于之前來說會更差，散戶保障降低，特別是對于那些專業知識缺乏，容易跟風的散戶投資者來說，獲利的難度大大增加，導致投資者虧損的因素增多。