新型冠狀病毒核酸檢測陰性時基本排除感染，如兩項抗體也是陰性，表明體內無新冠病毒，也無保護性抗體；新型冠狀病毒核酸檢測核酸陽性，抗體陰性時，表明處在窗口期或出現無癥狀感染者。目前新型冠狀病毒核酸檢測是，診斷新型冠狀病毒感染的標準，若懷疑感染新型冠狀病毒時，可做新型冠狀病毒核酸檢測。如果檢測結果呈陰性，基本上可排除感染；患新型冠狀病毒感染，經治療癥狀消退后，需進行新型冠狀病毒核酸檢測，檢測結果為陰性表明沒有檢測到新型冠狀病毒，代表疾病已治愈。一般是自身沒有受到新型冠狀病毒感染。
但是僅做一次核酸檢測陰性不能夠完全排除受檢者沒有被新型冠狀病毒感染，需要結合患者臨床表現以及肺部CT檢查來判斷。感染上病毒之后，會造成患者出現乏力和發熱以及干咳等癥狀，個別患者會伴隨著腹痛、腹瀉以及呼吸不暢等癥狀。這種疾病具有1~14天左右的潛伏期，做了第1次核酸檢測之后，需要自我隔離14天，然后再進行第2次核酸檢測，兩次檢查結果均為陰性，通常表示沒有感染上病毒。