醫保斷交三個月主要有以下兩個方面的影響：
1、影響醫保報銷
事實上醫保一旦斷繳，在斷交的次月就不能夠使用醫保的報銷功能了，參保人就需要自己承擔所有的就醫治療費用，而如果在斷保的三個月內及時繳納，發生了就醫治療費用，只要準備好了相關的就醫憑證和費用清單，還是能夠到醫保服務中心進行手動報銷的。
2、使得醫保累積繳納年限被清零
超過三個月沒有完成醫保的繳納，原先繳納醫保所累積的時間都會被清零，舉個例子，假設該參保人先前已經繳納了7年的醫保，結果斷交了三個月，這7年的累積繳納年限就會被清零，參保人這時候才開始繳納只能算作是重新參保，并且也不是重新繳費了就能夠直接使用醫保報銷功能，還需要經過6個月的恢復期，才能夠正常使用醫保報銷功能。
但是醫保斷交是不會影響醫保個人賬戶的使用的，只要該參保人的醫保個人賬戶中依舊有資金，參保人依舊可以使用醫保卡進行門診費用的支付或者到定點聯網醫療機構、藥店進行藥品的購買。