助學貸款可以通過支付寶或者銀行進行還款，其還款方法為：
一、支付寶在線還款。登錄之前發放貸款的支付寶賬號，搜索并關注生活號-國家開發銀行助學貸款，按照頁面提示點擊在線還款即可進行還款。
二、銀行線上還款。可以登錄國家開發銀行助學貸款信息網，申請提前還款。
三、銀行線下還款。攜帶銀行卡、本人身份證件等資料，在貸款辦理銀行營業網點領取填寫申請表，將資料交由柜臺工作人員即可辦理助學貸款還款。
助學貸款是按年進行還款，正常還款日為每年的12月20日之前，最后一年的還款日為9月20號之前，申請人可以按照合同規定按期還款，也可以選擇提前還款。提前還款需要在每年1到10月份的1號到10號之間進行申請，申請成功后，在當月的15號之前把錢存進去，系統會在當月20號進行自動扣款。
停息掛賬還完后，逾期記錄不會立即消除，從還清逾期的欠款之日算起，逾期記錄會在征信中保留5年，5年以后逾期記錄由征信系統自動刪除。因此，用戶還清逾期的欠款，立刻查詢征信，征信中仍然可以查到貸款逾期記錄，只不過已經還清的逾期記錄，負面影響會降低。
用戶越早還清逾期的欠款，逾期記錄就會越早刪除，沒有還清逾期的欠款，逾期記錄會一直保留。停息掛賬不能讓逾期記錄立刻被刪除，只能讓用戶在逾期期間不增加新的逾期利息，用戶可以在協商好的時間內歸還貸款本息以及逾期利息，停息掛賬實際上是降低用戶的還款壓力。
還有部分用戶申請停息掛賬會直接被拒絕，那么這種情況就只能盡快還清逾期的欠款，否則逾期記錄的負面影響會繼續擴大。