公積金貸款買房和商貸買房的區別主要在于：
1.利率不同：
公積金貸款執行的是央行貸款基準利率，而在央行公布的貸款基準利率當中，五年以上公積金貸款年利率為3.25%（二套公積金貸款利率為基準利率的1.1倍）。商業貸款則是以相應期限的LPR為定價基準加點形成。而5年期以上LPR報價為4.6%，至于基點數，各地各銀行都可能不一樣。
2.首付比例不同：
如果是建筑面積在九十平方米（含）以內的房屋，客戶申請公積金貸款購買首套房，那首付一般最低兩成就行了；建筑面積在九十平方米以上，首付比例最低是三成。而辦理商業貸款購買首套房，首付比例普遍得在三成（含）以上。
3.辦理機構不同：
公積金貸款一般是直接去當地的住房公積金管理中心辦理；而商業貸款則是客戶選定一家銀行辦理即可。
公積金可以申請到100萬的貸款，不過這需要貸款人所在地區的公積金中心支持這么高的貸款額度，比如說上海，上海家庭住房公積金貸款最高額度為100萬，個人為50萬。實際上大多數地區公積金貸款的額度都在100萬以下。
所以貸款人在申請公積金貸款以前，還是需要及時跟當地的公積金中心溝通，看看最高的可貸額度，以及需要準備的資料，盡早做好準備。如果公積金貸款額度不是很夠用的話，貸款人要么提高首付比例，要么就是選擇組合貸款，可以根據實際情況來選擇。
另外，就算是當地公積金貸款可以貸到100萬，那也需要貸款人申請貸款的時候，滿足貸100萬的要求，需要貸款人公積金賬戶里面有足夠的資金。一般來說公積金貸款額度是貸款人公積金賬戶余額的10——20倍，詳情可以咨詢當地的公積金中心。