公積金里的錢不夠還月供，用戶只要將剩余還款金額存入銀行卡中，等待系統從銀行卡扣款即可。用戶辦理了公積金對沖業務，系統會優先從公積金賬戶內扣錢還款，當扣款金額不足時，那么會繼續從還款銀行卡中扣錢還款。因此，只要用戶確保還款銀行卡中有足夠的余額，那么系統就可以扣滿月供金額。
系統會在還款日當天發起多次自動扣款，因此首次扣款金額不足，稍后系統會發起再次扣款。只要在還款日當天扣滿還款金額，銀行就會視為用戶按時還款，至于扣款次數的多少，并不會影響還款結果。當然，如果多次自動扣款失敗了，請選擇主動還款。
公積金貸款逾期會產生逾期記錄影響個人征信，哪怕還清逾期的欠款，逾期記錄也要在5年以后才會刪除。
公積金里的錢不可以用于支付首付。公積金的使用原因是先消費后提取，即用戶發生了購房的行為后，才可以申請提取公積金。不過實際情況通常是用戶滿足其他的公積金提取條件，將公積金賬戶內的余額提取出來后，再使用提取的資金支付購房款首付，只要銀行沒有監測到，通常也可以實現。
但是，一旦銀行監測到，可能會導致貸款申請失敗。因此，穩妥的做法是使用自己的資金支付購房款首付，而房貸審批成功后，再申請提取公積金。另外，公積金賬戶里的錢還可以用于歸還房貸，辦理公積金對沖業務，系統會自動從公積金賬戶里扣錢歸還房貸，而賬戶內余額不足時，才會扣除銀行卡的余額用于還款。
另外，公積金里的錢還會影響到公積金貸款額度，如果用戶申請的是商貸，則不受任何影響。