結膜炎的治療最佳治療方法包括藥物治療、手術治療。
1.藥物治療：細菌性結膜炎使用抗生素滴眼劑，如左氧氟沙星滴眼液；病毒性結膜炎可以選擇局部使用抗病毒滴眼劑，如更昔洛韋滴眼液；過敏性結膜炎選擇人工淚液稀釋過敏原，嚴重者需加用口服抗過敏藥物，如西替利嗪、氯雷他定等；以上用藥需要在醫生指導下使用。
2.手術治療：少數情況下可能發生結膜瘢痕，引起眼瞼和眼球粘連或眼瞼變形時，需要采取手術治療。
建議結膜炎患者及時醫院就診，明確病因，在醫生指導下選擇最佳的治療方案。
結膜炎需要通過點眼藥水及全身用藥來治療，細菌性結膜炎可以使用抗生素滴眼液治療，病毒性結膜炎可以使用抗病毒的滴眼液治療，而過敏性結膜炎需要使用抗過敏的藥物治療，同時還可以配合全身使用抗感染或抗過敏藥物治療。
細菌性結膜炎通常主要表現是眼部有大量黃色分泌物、眼睛充血、發紅等，可以通過點左氧氟沙星滴眼液，妥布霉素滴眼液，莫西沙星滴眼液等抗生素藥物進行治療，同時還可以配合全身使用抗感染藥物，例如阿莫西林膠囊治療。
病毒性結膜炎的主要表現是眼部有大量水樣分泌物，結膜有充血和出血等，可以點更昔洛韋滴眼液，阿昔洛韋滴眼液等治療。
過敏性結膜炎的主要表現是眼睛充血發紅，并且伴有瘙癢感，可以點鹽酸奧洛他定滴眼液等治療，同時還可以配合全身使用抗過敏藥物治療，例如氯雷他定片。
結膜炎患者應盡快至醫院就診，完善相關檢查，以免貽誤病情。