自身免疫性肝炎完全治愈的可能性比較小，需要長期的使用糖皮質激素或免疫抑制劑來控制病情，如果停藥，肝炎可能會復發，而且治療時間越長，停藥后病情復發的幾率就越低。單用糖皮質激素或聯合硫唑嘌呤治療是自身免疫性肝炎的標準治療方案，但需要長期堅持治療。
自身免疫性肝炎是由自身免疫反應介導的慢性進行性的肝臟炎癥性疾病，因機體免疫耐受機制破壞產生針對肝臟自身抗原的免疫反應，從而破壞肝細胞導致肝臟炎癥的壞死，并可以進展為肝纖維化、肝硬化。
規范的治療和診斷可以控制自身免疫性肝炎的進展，使病人壽命與正常人壽命沒有太大的差異，但如果不及時的治療進展到肝硬化，就會產生一系列的嚴重后果。