扁桃體發炎是兒童期比較常見的上呼吸道感染之一，一般分細菌感染和病毒感染。如果是細菌感染，可能需要使用到抗生素，如果是病毒感染引起，則以對癥治療為主。扁桃體炎發熱或劇烈疼痛時，可服用布洛芬或對乙酰氨基酚。
細菌感染中最常見的為A組鏈球菌。A組鏈球菌傳染性強，還可能導致猩紅熱、腎炎等，治療不及時對孩子影響大?？梢赃M行咽部快速鏈球菌抗原檢測（RADT），可能出現假陰性，此時可加做咽拭子鏈球菌培養。如果診斷為A群β溶血性鏈球菌感染，一般使用抗生素抗感染治療，首選阿莫西林或者阿莫西林克拉維酸鉀，也可以使用頭孢類藥物。
病毒感染也會引起扁桃體炎，常見的有腺病毒、EB病毒感染，此外柯薩奇病毒、埃可病毒、流感病毒、副流感病毒感染也不少，極少數為單純皰疹病、呼吸道合胞病毒等病毒感染。需要注意是EB病毒感染引起的傳染性單核細胞增多癥（簡稱“傳單”），會合并發熱、明顯鼻塞、頸淋巴結腫大、脾腫大和肝酶升高。病毒感染治療主要為對癥處理，目前研究發現使用抗病毒藥物并沒有獲益，因此并不推薦。